עפרת יקבל פרס העומד על 50,000 ₪. פרס האוצר מוענק זו השנה החמישית על ידי משרד התרבות והספורט ומטרתו להביע הערכה והוקרה לעבודת האוצר המקצועי, לסייע לו להתמקד ולהעמיק בתחום מחקרו ובכך לתרום להקמת תערוכות מקצועיות ומצטיינות בחללי התצוגה בארץ.

 ועדת השיפוט לבחירת פרס האוצר לשנת 2009 כללה את השופטים: נעמי אביב (יו"ר), נעמה ברוש, רותי דירקטור, עדנה מושנזון, עירית ציפר ועידית עמיחי כמשקיפה מטעם משרד התרבות והספורט, התכנסה בתחילת השבוע ובחרה בגדעון עפרת מתוך רשימה של 14 מועמדים.

מנימוקי השופטים:  "פרס האוצר 2009 מוענק לגדעון עפרת על תרומתו החשובה למחקרה, מיפויה וכתיבתה של האמנות הישראלית, על תרומתו למוסד האוצרות הישראלי, על ניסיונו להרחיב את גבולות התחום והגדרותיו, ועל יציקת תוכן, אנרגיה ומעמד של יוצר לתפקיד האוצר".